プレプリントの公開については、筆者と読者のどちらにとっても明らかな利点があるものの、学術分野によっては今なお意見が分かれています。

もし皆さんがプレプリントを読んだり公開したりすることに慣れていなければ、プレプリントを公開した方が良いのかどうか迷うこともあるでしょう。

そこでこの記事では、プレプリントを公開するという選択が自分にとって適切かどうかを皆さんが判断する一助となるように、以下について解説します。

• プレプリントの特徴
• プレプリントとして研究を早期および無制限に共有することの有用性
• 特定の学術領域におけるプレプリント公開の落とし穴
• プレプリントプラットフォームの例
• プレプリントを公開することが正しい選択かどうかを判断するのに役立つ12項目のチェックリスト

プレプリントは、ジャーナルに掲載されている論文のように見える原稿ですが、その内容は査読を受けておらず、フォーマットも特定のジャーナルのスタイルに厳密に沿っているわけではありません。プレプリントは「著者自身のバージョン」、つまり査読やジャーナルのコピーエディットなどを通して修正される前の段階の原稿ですが、そこに書かれている内容の質が低いということを意味するものではありません。

プレプリントは、オープンアクセスプラットフォーム（プレプリントサーバーやその他の公開リポジトリ）または機関や個人のウェブサイト上で公開することができます。プラットフォームやリポジトリの多くは特定の分野に特化しています。例えば、最も古くからあり、おそらく最も知名度の高いプレプリントサーバーであるaRxiv （「archive（アーカイブ）」と読む）は、物理、数学、コンピューターサイエンスなどのプレプリントを受け付けています。プレプリントは査読を受けていませんが、サーバーやリポジトリによっては、不適切な内容のものが登録されることを防ぐために登録前にスクリーニングのステップを設けているものもあります。

プレプリントサーバーには読者からのフィードバックもアップロードでき、著者はそれを基に研究を発展させたり原稿を改善したりしたうえで、ジャーナルに研究論文として投稿することができます。全てではありませんが、多くのプレプリントが最終的にはジャーナルに公表されています。

プレプリントとして公開された原稿は、ジャーナルへの投稿前であればいつでも改訂することができます。著者は、改訂版ごとにタイムスタンプを自動的に付与し、履歴を閲覧できるようにするかどうかを決めなければなりません。プレプリントサーバーによって細かい差違はあるのですが、タイムスタンプは単に新しいバージョンが登録されたときの記録でしかありません。そのタイムスタンプを改訂版ごとに付与し、かつ、全ての改訂版のプレプリントの閲覧を可能にする自動バージョンコントロール機能を備えたプレプリントサーバーが数多く存在します。

プレプリントには多くの場合、永続的な記録となるdigital object identifier（DOI）が付与されます。DOIが付与されることにより、他の研究者がプレプリントを参考文献として引用できるようになり、プレプリントとジャーナルに掲載された最終版との関連性も明確になり、最終版がジャーナルに掲載される以前に著者の研究成果として履歴書に記載することもできるようになります。プレプリントを公開してからその内容に問題があることに気が付いた場合、DOIが付与されたプレプリントを記録から完全に削除することは不可能です。著者が、プレプリントの取り下げを正式に申請することは可能ですが、この場合、「Withdrawn」の表示が取り下げの理由と共に示され、内容は削除されるものの、プレプリントの著者名、タイトル、DOIなどのメタデータは残ります（プレプリントの正式な撤回プロセスの例として、こちらまたはこちらをご覧ください）。プレプリントの取り下げは、掲載された論文の撤回と同様に大変なことなので、できる限りの注意を払い回避しなければなりません。また、プレプリントサーバーから取り下げたにもかかわらず、一般的なサーチエンジンにコピーされたプレプリントが閲覧され続ける可能性もあります。

ジャーナルに投稿する原稿と同様に、プレプリントも出版・公表のベストプラクティスに従って作成されるべきです。特に、インフォームドコンセント、研究参加者の匿名性、剽窃・テキストの重複の回避、画像の再使用の許諾などの倫理要件には十分な注意を払うべきです。また、公開する全てのバージョンのプレプリントは、全ての共著者から合意を得られたものでなければなりません。

プレプリントがどのようなライセンス規約（クリエイティブコモンズのCC0やCC BYなど）のもとに公開されるのかも考慮する必要があります。例えば、Wiley社は、プレプリントサーバーに研究を公開する際は、著者が著作権、好ましくは「no re-use（再利用禁止）」のライセンスを保持すべきであるとしています。クリエイティブコモンズの各ライセンス（著作権の放棄を含む）によりどのような権利が守られ、どのような2次利用が承諾されるのかについては、ASAPbioによるダイアクラムを参照してください。どのライセンスを選択するかにより、プレプリントがどのように共有され、再利用されるかが決まります。

プレプリントの公開に対して、過去には抵抗があった分野も存在します。例えば、Natureのプレプリントに対する方針は、反対から容認へ、さらには積極的な奨励へと変化しました。以前は、プレプリントは事前掲載とみなされ投稿原稿として受け付けられませんでした。現在は、オープンサイエンスが支持を得てきた背景もあり、プレプリントを容認・奨励するようになったジャーナルや学術出版社が増え、中には、プレプリントサーバーから直接転送されたプレプリントを投稿原稿として受け入れるところもあります。とはいえ、全てのジャーナルがプレプリントを受け入れているわけではないため、プレプリントを公開する前に必ずターゲットジャーナルの投稿規定を確認することをお勧めします。

プレプリントの公開は、著者および読者（研究コミュニティ、研究費提供者、一般市民など）に多くの利点をもたらします。

• スピード：プレプリントを公開することにより、研究の迅速な共有と、世界中の幅広い読者からのフィードバックが期待されます。ジャーナルへ原稿を投稿した場合、査読者からのコメントを数週間、あるいは数か月待つこともあり、また、得られるフィードバックは2、3人の査読者からのみです。この迅速さは、物議をかもすような結果に対してフィードバックを得たい場合などに特に有用です。得られたフィードバックを基にプレプリントを改訂し、それからジャーナルに投稿することが可能となるからです。
• 発展：査読付きジャーナルに投稿する前であれば、プレプリントは何回でも改訂することができます。各改訂版にタイムスタンプを付与することにより（バージョンコントロール機能を使って、または手作業で）、研究がどのように発展したかの記録になります。
• 可視性：プレプリントの公開により、研究成果の可視性が高まります。ジャーナルに掲載された最終版の原稿は有料のため読むことができない読者でも、無料のプレプリントは読む可能性があります。また、プレプリントが大規模なプレプリントサーバーに登録されてDOIが付与されると、最終版がジャーナルに掲載されるよりも前に、多くの研究者に参照され、論文に引用される可能性があります。また、プレプリントが、将来の共同研究者の注意を引く可能性もあります。
• 先取権 ：プレプリントで公開した研究についての先取権（プライオリティ）を確立することができるため、自身の知的所有権を守り、研究の認知度を上げることに役立ちます。
• 影響度：展開の早い分野においては、プレプリントで結果を早期に公開する意義は大きく、公開された結果がその分野の研究の将来の方向性に大きな影響を与えます。また、履歴書にプレプリントリストを含めると、ジャーナルに掲載された研究以外の研究の成果を示すことができ、研究費申請書にプレプリントを引用することにより、申請研究の内容をより良く説明することもできます。

次のようなリスクから、プレプリントの公開を懸念する領域があります。プレプリントを公開する前には慎重な検討が必要です。

• スピード：バイオメディカル領域では、プレプリントによって研究結果が早期に（研究のインテグリティが査読により正式に審査される前に）公開されることによる実害が懸念されています。例えば、薬剤の安全性または有効性について正しくない結論が述べられていれば、患者に被害が及ぶでしょう。実際、ヘルスサイエンス分野のプレプリントサーバーmedRxivでは、公開されるプレプリントを誤用または誤解釈することがないよう読者（研究者、メディア、および一般市民）に警告しています。プレプリントに関連する倫理問題は、全ての学術領域において討議されている問題の１つです。
• 可視性と影響度：プレプリントとして公開された研究を掲載しないジャーナルもあります。したがって、プレプリントを公開することにより、後にどのジャーナルで最終版を公表するかの選択に影響が及び、ひいては自身の研究の可視性と影響度が変わってくる可能性があります。
• 先取権：プレプリントを公開すると、他の研究者にアイディアを与えてしまい、出し抜かれる（自分よりも先にジャーナルで公表されてしまう）可能性があることを懸念する研究者もいます。このようなことが起こらないとは限りませんが、プレプリントで公開された研究がすぐに再現される可能性は低く、また、多くのプレプリントにはタイムスタンプが付与されるため、それにより先取権は確立されます。

数学や物理学などの学術領域ではプレプリントの公開が慣例となっており、このような考慮すべき落とし穴はほとんどないと考えられます。しかしながら、医学やヘルスケアをはじめとするそれ以外の領域では、プレプリントを登録する前に、投稿予定のジャーナルがプレプリントを容認するか否かを確認すべきでしょう。

プレプリントプラットフォーム（またはプレプリントサーバー）のリストはオンラインで見ることができます。自分の研究領域を対象としたサーバーを探すときにはこちらのリストまたは記事を参考にしてください。ただし、自分の研究や自分自身の状況に適したプラットフォーム、リポジトリまたはウェブサイトであるかどうかは必ず各自で確認してください。

AfricArxivやindiaRxivなどの地域のサーバーに登録するのも、その地域についての研究やその地域の言語で書かれたプレプリントには良い選択でしょう。しかしながら、このような地域のサーバーの中には、最近、インドネシアのプレプリントリポジトリINA-Rxivにみられるように、運営資金繰りが困難となっているところもあります。

• プレプリントの公開には自分にとってどのような利点があるか？
  （先取権の確立、永久的な学術記録であるDOIが付くことにより引用しやすくなる、フィードバックを得て研究をさらに進展させてからジャーナルに投稿することができるなど。）
• 第一候補のジャーナルはプレプリントを容認しているか？
• 第二候補以降のジャーナルはプレプリントを容認しているか？
  （投稿した論文が第一候補のジャーナルで不採用となった場合に備えて）
• プレプリントを公開するのに最もふさわしい場はどこか？
  （プレプリントサーバー、それ以外の公開リポジトリ、所属研究チームのウェブサイトなど）
• 公開されたプレプリントにタイムスタンプを付加して、先取権を確保したいか？
• プレプリントの公開について全ての共著者の合意が得られているか？
• プレプリントは出版・公表のベストプラクティスに従っているか？
  （インフォームドコンセント、研究参加者の匿名性、剽窃・テキストの重複がない、画像の再使用の許可を得ているなどの倫理要件を満たしているか）
• ライセンスの種類は著者のニーズに合致しているか？
  （クリエイティブコモンズCC0、CC BYなど）
• プレプリントの引用にはどの識別子（DOI、arXiv ID、URLなど）が使われるか？
• バージョン管理システムがあるか？
• 指定されたプレプリントのフォーマットは何で（通常はPDF）、ファイルのサイズに制限はあるか？
• 最終版のプレプリントをプレプリントサーバーから直接転送してターゲットジャーナルに投稿することは可能か？
  （ジャーナルによっては、プレプリントの初版を公開する際にこの機能を選択できる場合がある）

学術文書の公表におけるプレプリントの位置付けはめまぐるしく変化しており、プレプリントを公開する選択肢も以前よりは広がっています。プレプリントでは、学会で発表される予備研究の結果のような、最新の、そして多くの場合は早期の研究結果が公開されるため、その学術領域における現在の方向性についての知見やインスピレーションを読者は得ることができます。また、多くのプラットフォームでは読者からのコメントを受け付けており、プレプリントの進展に貢献しています（これは、ジャーナルに投稿した原稿が査読を受けて改善されるプロセスに似ています）。一方で読者は、プレプリントは正式な査読を受けていないこと、また、引用する場合はプレプリントの過剰な引用を好まず特別な引用法を指定するジャーナル（Nucleic Acids Researchなど）があることを常に心にとめておく必要があります。

プレプリントの公開に際しては、自分の研究領域の研究を登録できるプレプリントサーバーがあるかだけでなく、使用するライセンス（クリエイティブコモンズCC0またはCC BY）、どのような識別子（プレプリントが引用される際に使用されるDOI、arXiv ID、URLなど）が付与されるか、サーバーの特別な機能（バージョンコントロール、ジャーナルへのファイルの直接転送など）、出版・公表倫理などの要素も考慮しなければなりません。

プレプリントの変革的な役割については、2020年に「情報の科学と技術」に掲載されたレビューや、2019年9月にKnowledge Exchangeから公表された包括的な報告書をご覧ください。また、関連する倫理については、Committee on Publication Ethics（COPE）から公開されているディスカッションペーパーや、パネルと聴衆の活発な討論の様子を見ることができる2019年のパネルディスカッションのビデオをご覧ください。その他にも質問などがありましたらThinkSCIENCEまでご連絡ください。